Promotie
Veelzijdig FRUITFULL - Redundantie en Specificiteit in Tomaat
Samenvatting
Vruchtontwikkeling en -rijping bij tomaten omvatten de coördinatie en strakke regulatie van genexpressie. MADS-domeintranscriptiefactoren, genexpressie regulerende eiwitten, spelen een cruciale rol in verschillende biologische processen van planten, en interacties tussen MADS-domeineiwitten, zijn essentieel voor hun functies. In tomaat zijn verschillende MADS-domeineiwitten geïdentificeerd, zoals FUL1, FUL2, MADS-RIN, TAGL1 en MADS1, die een rol spelen bij de ontwikkeling en rijping van fruit, maar een diepgaande karakterisering van hun unieke en (gedeeltelijk) redundante functies in deze processen ontbreekt. In dit project streefde ik ernaar de regulerende functies van MADS-box-eiwitten, met name FUL1, FUL2 en TAGL1, en de interacties tussen hen en met andere eiwitten verder te verhelderen. Eerst heb ik CRISPR/Cas gebruikt om enkele mutanten en combinaties daarvan te genereren om eventuele redundante functies of coöperativiteit tussen deze eiwitten tijdens de ontwikkeling en rijping van vruchten te onthullen. Ten tweede analyseerde ik ook de gedetailleerde temporele en ruimtelijke expressie van de FUL's om specifieke targets en cofactoren te identificeren. Ten derde gebruikte ik de resultaten om een regulatiemodel voor de rijping van tomatenvruchten te ontwikkelen, waarbij mutagenese, expressieprofielen en interactiegegevens werden meegenomen. Al met al zal deze studie het moleculaire regulatienetwerk van MADS-BOX-eiwitten, met name FUL1/2, in de ontwikkeling en rijping van vruchten verhelderen.